Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PGBD1Q96JS3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PGBD1Q96JS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGBD1Q96JS3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms