Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC136Q96JN2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC136Q96JN2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC136Q96JN2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC136Q96JN2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms