Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC11Q96J66 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC11Q96J66 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ABCC11Q96J66 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ABCC11Q96J66 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC11Q96J66 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms