Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MKL1Q969V6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MKL1Q969V6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MKL1Q969V6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MKL1Q969V6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKL1Q969V6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKL1Q969V6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKL1Q969V6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MKL1Q969V6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MKL1Q969V6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MKL1Q969V6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MKL1Q969V6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MKL1Q969V6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MKL1Q969V6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MKL1Q969V6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKL1Q969V6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKL1Q969V6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKL1Q969V6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKL1Q969V6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKL1Q969V6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MKL1Q969V6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MKL1Q969V6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MKL1Q969V6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MKL1Q969V6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
MKL1Q969V6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MKL1Q969V6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKL1Q969V6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKL1Q969V6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MKL1Q969V6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MKL1Q969V6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
MKL1Q969V6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MKL1Q969V6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MKL1Q969V6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms