Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC46.39■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.38■■■■■ 5.02
RB1CC1Q8TDY2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.37■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC46.37■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC46.36■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC46.35■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC46.34■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC46.34■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC46.33■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5.01
RB1CC1Q8TDY2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC46.3■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC46.29■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC46.28■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC46.28■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
RB1CC1Q8TDY2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC46.25■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC46.23■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC46.22■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC46.21■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC46.19■■■■■ 4.99
RB1CC1Q8TDY2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
RB1CC1Q8TDY2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.12■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC46.08■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC46.07■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC46.07■■■■■ 4.97
RB1CC1Q8TDY2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC46.04■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
RB1CC1Q8TDY2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC46.03■■■■■ 4.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms