Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RPAP2Q8IXW5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAP2Q8IXW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
RPAP2Q8IXW5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAP2Q8IXW5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms