Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCF2L2Q86YR7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MCF2L2Q86YR7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms