Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
STRCQ7RTU9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
STRCQ7RTU9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
STRCQ7RTU9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
STRCQ7RTU9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
STRCQ7RTU9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms