Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHLHA9Q7RTU4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BHLHA9Q7RTU4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BHLHA9Q7RTU4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms