Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
LRRC9Q6ZRR7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LRRC9Q6ZRR7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LRRC9Q6ZRR7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
LRRC9Q6ZRR7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms