Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CCDC141Q6ZP82 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CCDC141Q6ZP82 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CCDC141Q6ZP82 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC141Q6ZP82 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms