Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMOD2Q6P5Q4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
LMOD2Q6P5Q4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
LMOD2Q6P5Q4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMOD2Q6P5Q4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms