Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNCKQ6P2M8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNCKQ6P2M8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNCKQ6P2M8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.8 ms