Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMTC4Q5T4D3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMTC4Q5T4D3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms