Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NHSL1Q5SYE7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NHSL1Q5SYE7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NHSL1Q5SYE7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NHSL1Q5SYE7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms