Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC27Q2M243 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC27Q2M243 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC27Q2M243 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC27Q2M243 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms