Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NECTIN1Q15223 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NECTIN1Q15223 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NECTIN1Q15223 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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