Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEDD9Q14511 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEDD9Q14511 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD9Q14511 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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