Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNAPC2Q13487 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNAPC2Q13487 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNAPC2Q13487 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNAPC2Q13487 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms