Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
SLFN5Q08AF3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SLFN5Q08AF3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SLFN5Q08AF3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms