Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBE3AQ05086 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE3AQ05086 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE3AQ05086 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms