Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IRX1P78414 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX1P78414 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX1P78414 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX1P78414 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX1P78414 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX1P78414 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IRX1P78414 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IRX1P78414 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IRX1P78414 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX1P78414 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX1P78414 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX1P78414 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRX1P78414 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX1P78414 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX1P78414 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX1P78414 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX1P78414 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX1P78414 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX1P78414 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX1P78414 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRX1P78414 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX1P78414 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX1P78414 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX1P78414 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX1P78414 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX1P78414 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRX1P78414 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRX1P78414 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRX1P78414 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX1P78414 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX1P78414 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX1P78414 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX1P78414 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX1P78414 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX1P78414 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IRX1P78414 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX1P78414 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRX1P78414 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX1P78414 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX1P78414 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX1P78414 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX1P78414 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX1P78414 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRX1P78414 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX1P78414 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX1P78414 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX1P78414 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX1P78414 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX1P78414 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
IRX1P78414 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms