Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AIF1P55008 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIF1P55008 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIF1P55008 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIF1P55008 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AIF1P55008 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AIF1P55008 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AIF1P55008 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AIF1P55008 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AIF1P55008 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AIF1P55008 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AIF1P55008 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AIF1P55008 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AIF1P55008 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AIF1P55008 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
AIF1P55008 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AIF1P55008 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AIF1P55008 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AIF1P55008 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AIF1P55008 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AIF1P55008 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AIF1P55008 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AIF1P55008 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AIF1P55008 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AIF1P55008 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AIF1P55008 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AIF1P55008 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AIF1P55008 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AIF1P55008 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AIF1P55008 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AIF1P55008 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AIF1P55008 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AIF1P55008 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AIF1P55008 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AIF1P55008 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AIF1P55008 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AIF1P55008 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AIF1P55008 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AIF1P55008 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AIF1P55008 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AIF1P55008 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIF1P55008 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIF1P55008 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AIF1P55008 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIF1P55008 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIF1P55008 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIF1P55008 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIF1P55008 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AIF1P55008 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIF1P55008 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIF1P55008 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIF1P55008 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIF1P55008 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIF1P55008 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIF1P55008 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AIF1P55008 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIF1P55008 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIF1P55008 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIF1P55008 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIF1P55008 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AIF1P55008 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIF1P55008 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIF1P55008 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIF1P55008 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIF1P55008 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIF1P55008 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIF1P55008 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AIF1P55008 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIF1P55008 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AIF1P55008 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms