Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCN3P51790 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCN3P51790 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCN3P51790 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms