Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BRCA2P51587 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRCA2P51587 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
BRCA2P51587 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BRCA2P51587 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms