Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCT4P50991 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCT4P50991 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCT4P50991 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCT4P50991 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCT4P50991 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCT4P50991 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCT4P50991 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCT4P50991 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCT4P50991 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCT4P50991 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCT4P50991 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCT4P50991 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CCT4P50991 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCT4P50991 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCT4P50991 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCT4P50991 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCT4P50991 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCT4P50991 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCT4P50991 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCT4P50991 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCT4P50991 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCT4P50991 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCT4P50991 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CCT4P50991 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCT4P50991 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCT4P50991 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCT4P50991 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCT4P50991 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCT4P50991 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCT4P50991 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCT4P50991 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCT4P50991 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCT4P50991 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCT4P50991 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCT4P50991 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCT4P50991 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCT4P50991 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCT4P50991 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCT4P50991 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCT4P50991 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCT4P50991 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCT4P50991 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCT4P50991 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCT4P50991 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCT4P50991 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCT4P50991 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCT4P50991 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCT4P50991 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCT4P50991 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCT4P50991 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCT4P50991 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCT4P50991 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCT4P50991 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCT4P50991 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCT4P50991 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCT4P50991 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCT4P50991 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCT4P50991 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCT4P50991 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCT4P50991 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCT4P50991 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCT4P50991 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms