Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTDSS1P48651 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTDSS1P48651 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms