Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT2P35908 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT2P35908 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT2P35908 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT2P35908 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT2P35908 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT2P35908 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT2P35908 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT2P35908 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT2P35908 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT2P35908 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT2P35908 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT2P35908 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT2P35908 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT2P35908 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT2P35908 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT2P35908 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT2P35908 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT2P35908 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT2P35908 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT2P35908 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT2P35908 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT2P35908 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT2P35908 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT2P35908 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT2P35908 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT2P35908 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT2P35908 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT2P35908 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT2P35908 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT2P35908 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT2P35908 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT2P35908 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT2P35908 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT2P35908 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT2P35908 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT2P35908 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT2P35908 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT2P35908 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT2P35908 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT2P35908 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT2P35908 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT2P35908 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT2P35908 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT2P35908 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT2P35908 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT2P35908 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT2P35908 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT2P35908 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT2P35908 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT2P35908 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT2P35908 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT2P35908 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT2P35908 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT2P35908 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT2P35908 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT2P35908 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT2P35908 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT2P35908 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT2P35908 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT2P35908 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT2P35908 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT2P35908 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT2P35908 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT2P35908 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT2P35908 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT2P35908 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT2P35908 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT2P35908 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT2P35908 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT2P35908 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT2P35908 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT2P35908 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms