Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM5AP29375 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM5AP29375 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM5AP29375 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms