Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTGFP29279 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTGFP29279 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTGFP29279 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTGFP29279 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTGFP29279 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTGFP29279 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTGFP29279 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTGFP29279 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTGFP29279 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTGFP29279 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTGFP29279 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTGFP29279 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTGFP29279 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTGFP29279 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTGFP29279 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTGFP29279 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTGFP29279 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTGFP29279 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTGFP29279 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CTGFP29279 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTGFP29279 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTGFP29279 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTGFP29279 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTGFP29279 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTGFP29279 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTGFP29279 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTGFP29279 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CTGFP29279 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTGFP29279 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTGFP29279 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTGFP29279 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTGFP29279 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTGFP29279 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTGFP29279 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTGFP29279 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTGFP29279 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTGFP29279 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTGFP29279 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTGFP29279 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTGFP29279 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTGFP29279 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTGFP29279 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTGFP29279 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTGFP29279 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTGFP29279 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTGFP29279 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTGFP29279 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTGFP29279 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTGFP29279 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTGFP29279 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTGFP29279 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTGFP29279 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTGFP29279 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTGFP29279 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTGFP29279 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTGFP29279 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTGFP29279 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTGFP29279 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTGFP29279 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTGFP29279 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTGFP29279 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTGFP29279 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTGFP29279 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTGFP29279 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTGFP29279 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTGFP29279 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTGFP29279 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTGFP29279 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTGFP29279 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTGFP29279 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTGFP29279 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTGFP29279 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTGFP29279 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTGFP29279 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTGFP29279 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTGFP29279 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTGFP29279 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTGFP29279 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTGFP29279 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTGFP29279 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTGFP29279 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms