Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
DUSP1P28562 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP1P28562 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms