Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STMN1P16949 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STMN1P16949 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STMN1P16949 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STMN1P16949 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STMN1P16949 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STMN1P16949 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STMN1P16949 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STMN1P16949 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STMN1P16949 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STMN1P16949 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STMN1P16949 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STMN1P16949 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STMN1P16949 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STMN1P16949 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STMN1P16949 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STMN1P16949 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STMN1P16949 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
STMN1P16949 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STMN1P16949 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STMN1P16949 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STMN1P16949 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STMN1P16949 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STMN1P16949 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STMN1P16949 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STMN1P16949 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STMN1P16949 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STMN1P16949 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STMN1P16949 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STMN1P16949 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STMN1P16949 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STMN1P16949 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STMN1P16949 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STMN1P16949 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STMN1P16949 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STMN1P16949 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STMN1P16949 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STMN1P16949 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STMN1P16949 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STMN1P16949 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STMN1P16949 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STMN1P16949 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms