Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPGDP15428 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPGDP15428 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HPGDP15428 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HPGDP15428 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDP15428 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDP15428 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDP15428 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDP15428 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPGDP15428 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPGDP15428 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
HPGDP15428 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPGDP15428 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HPGDP15428 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPGDP15428 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPGDP15428 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPGDP15428 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HPGDP15428 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPGDP15428 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDP15428 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDP15428 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDP15428 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDP15428 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDP15428 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HPGDP15428 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HPGDP15428 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HPGDP15428 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HPGDP15428 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPGDP15428 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms