Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRFP10586 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRFP10586 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRFP10586 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRFP10586 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRFP10586 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRFP10586 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRFP10586 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRFP10586 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRFP10586 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRFP10586 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRFP10586 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRFP10586 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRFP10586 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRFP10586 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRFP10586 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRFP10586 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRFP10586 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRFP10586 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRFP10586 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRFP10586 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRFP10586 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRFP10586 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRFP10586 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRFP10586 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRFP10586 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRFP10586 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRFP10586 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRFP10586 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRFP10586 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRFP10586 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRFP10586 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRFP10586 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRFP10586 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRFP10586 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRFP10586 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRFP10586 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PTPRFP10586 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRFP10586 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms