Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCBP10092 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CALCBP10092 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CALCBP10092 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALCBP10092 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALCBP10092 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALCBP10092 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCBP10092 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCBP10092 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCBP10092 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCBP10092 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCBP10092 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCBP10092 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCBP10092 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALCBP10092 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCBP10092 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCBP10092 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCBP10092 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALCBP10092 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCBP10092 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCBP10092 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCBP10092 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCBP10092 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCBP10092 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALCBP10092 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALCBP10092 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALCBP10092 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CALCBP10092 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CALCBP10092 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCBP10092 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms