Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GLI2P10070 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GLI2P10070 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
GLI2P10070 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
GLI2P10070 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GLI2P10070 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GLI2P10070 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GLI2P10070 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GLI2P10070 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GLI2P10070 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GLI2P10070 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GLI2P10070 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GLI2P10070 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GLI2P10070 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
GLI2P10070 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GLI2P10070 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GLI2P10070 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GLI2P10070 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GLI2P10070 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GLI2P10070 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GLI2P10070 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GLI2P10070 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GLI2P10070 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GLI2P10070 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GLI2P10070 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GLI2P10070 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
GLI2P10070 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GLI2P10070 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GLI2P10070 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GLI2P10070 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
GLI2P10070 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GLI2P10070 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GLI2P10070 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GLI2P10070 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GLI2P10070 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
GLI2P10070 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
GLI2P10070 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI2P10070 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI2P10070 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
GLI2P10070 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
GLI2P10070 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GLI2P10070 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
GLI2P10070 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GLI2P10070 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GLI2P10070 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
GLI2P10070 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
GLI2P10070 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GLI2P10070 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
GLI2P10070 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
GLI2P10070 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GLI2P10070 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
GLI2P10070 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GLI2P10070 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
GLI2P10070 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GLI2P10070 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GLI2P10070 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GLI2P10070 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GLI2P10070 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GLI2P10070 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
GLI2P10070 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
GLI2P10070 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
GLI2P10070 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
GLI2P10070 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GLI2P10070 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GLI2P10070 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
GLI2P10070 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GLI2P10070 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GLI2P10070 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
GLI2P10070 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GLI2P10070 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GLI2P10070 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
GLI2P10070 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
GLI2P10070 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GLI2P10070 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
GLI2P10070 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GLI2P10070 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GLI2P10070 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GLI2P10070 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GLI2P10070 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
GLI2P10070 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GLI2P10070 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
GLI2P10070 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GLI2P10070 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GLI2P10070 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
GLI2P10070 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GLI2P10070 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GLI2P10070 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
GLI2P10070 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GLI2P10070 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
GLI2P10070 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
GLI2P10070 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
GLI2P10070 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
GLI2P10070 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GLI2P10070 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GLI2P10070 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GLI2P10070 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GLI2P10070 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GLI2P10070 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
GLI2P10070 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
GLI2P10070 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms