Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GJB6O95452 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB6O95452 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB6O95452 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB6O95452 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB6O95452 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB6O95452 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB6O95452 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB6O95452 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB6O95452 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB6O95452 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB6O95452 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB6O95452 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB6O95452 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB6O95452 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB6O95452 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB6O95452 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB6O95452 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB6O95452 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB6O95452 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB6O95452 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB6O95452 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB6O95452 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB6O95452 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB6O95452 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB6O95452 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB6O95452 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB6O95452 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB6O95452 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB6O95452 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB6O95452 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB6O95452 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB6O95452 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB6O95452 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB6O95452 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB6O95452 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB6O95452 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB6O95452 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB6O95452 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB6O95452 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB6O95452 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB6O95452 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB6O95452 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB6O95452 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB6O95452 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB6O95452 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB6O95452 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB6O95452 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB6O95452 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB6O95452 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB6O95452 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB6O95452 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB6O95452 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB6O95452 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB6O95452 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB6O95452 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB6O95452 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB6O95452 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB6O95452 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB6O95452 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB6O95452 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB6O95452 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB6O95452 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB6O95452 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB6O95452 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms