Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC48.22■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.21■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC48.19■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC48.19■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC48.18■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC48.17■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC48.16■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC48.16■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC48.16■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC48.16■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC48.15■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC48.14■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.13■■■■■ 5.3
ABCC9O60706 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.13■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC48.12■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.12■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC48.12■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC48.11■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC48.11■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC48.11■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC48.1■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC48.09■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC48.08■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC48.07■■■■■ 5.29
ABCC9O60706 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC48.05■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC48.04■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC48.02■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC48.02■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC48.02■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC48.02■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.01■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC48.01■■■■■ 5.28
ABCC9O60706 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC47.98■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC47.98■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC47.97■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC47.96■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC47.95■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.27
ABCC9O60706 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC47.94■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.91■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC47.91■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC47.91■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC47.9■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC47.89■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC47.89■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms