Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP1O00294 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP1O00294 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP1O00294 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP1O00294 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TULP1O00294 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP1O00294 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP1O00294 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP1O00294 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP1O00294 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TULP1O00294 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP1O00294 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP1O00294 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP1O00294 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP1O00294 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP1O00294 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP1O00294 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP1O00294 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP1O00294 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP1O00294 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP1O00294 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP1O00294 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP1O00294 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP1O00294 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP1O00294 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP1O00294 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP1O00294 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP1O00294 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP1O00294 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP1O00294 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
TULP1O00294 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP1O00294 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP1O00294 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TULP1O00294 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP1O00294 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP1O00294 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP1O00294 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TULP1O00294 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP1O00294 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TULP1O00294 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TULP1O00294 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TULP1O00294 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP1O00294 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP1O00294 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP1O00294 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP1O00294 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP1O00294 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TULP1O00294 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP1O00294 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TULP1O00294 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TULP1O00294 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TULP1O00294 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TULP1O00294 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms