Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRAPPC2LH3BP13 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC2LH3BP13 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC2LH3BP13 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms