Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C5orf49A4QMS7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C5orf49A4QMS7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C5orf49A4QMS7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms