Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NCOA3Q9Y6Q9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NCOA3Q9Y6Q9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
NCOA3Q9Y6Q9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
NCOA3Q9Y6Q9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NCOA3Q9Y6Q9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms