Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB6Q9Y5E3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PCDHB6Q9Y5E3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHB6Q9Y5E3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB6Q9Y5E3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms