Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COQ4Q9Y3A0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COQ4Q9Y3A0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms