Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HIGD1AQ9Y241 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HIGD1AQ9Y241 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms