Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXW11Q9UKB1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXW11Q9UKB1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXW11Q9UKB1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms