Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA12Q9UI09 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDUFA12Q9UI09 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms