Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCF20Q9UGU0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF20Q9UGU0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF20Q9UGU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF20Q9UGU0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms