Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX16Q9P0S2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX16Q9P0S2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
COX16Q9P0S2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms