Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNA2D2Q9NY47 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CACNA2D2Q9NY47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms